Проєкти міжнародної технічної допомоги можуть охоплювати фінансування, закупівлю товарів і ввезення обладнання, тож їх податковий режим залежить від правового оформлення та фактичних операцій. У площині податку на прибуток порушено питання про оподаткування коштів МТД і врахування амортизації основних засобів, придбаних або збудованих за ці кошти. У сфері ПДВ розглядаються право на податковий кредит за придбаннями, оплаченими фінансуванням МТД, правила оподаткування постачань у межах проєкту та можливість пільги при ввезенні товарів в Україну. Окремо враховуються положення міжнародної угоди, реєстраційної картки проєкту, плану закупівлі та порядок взаємодії з митними органами.